В основе истории фильма лежит противостояние двух мужчин, двух несовместимых интересов. Действие происходит на Кубе. Молодой кубинец Эль Медико пытается улучшить условия жизни своей семьи, работая врачом. Но мечта у Эль Медико совсем другая: он хочет стать звездой кубинского реггетона, так как его занятие по призванию это – музыка. Эль Медико знакомится с Мишелем (Мишель Михлис), европейским музыкальным продюсером, которого интересует лишь то, как бы продать подороже того или иного артиста. Так разворачивается борьба между совершенно разными подходами к музыке: один видит музыку как подлинное и естественное выражение кубинской культуры и истории, другой – как коммерческий продукт, который должен продаваться.Помимо этого противостояния фильм «Кубатон» дает картину современной Кубы, в которой коммунизм породил мировоззрение, демонстративно игнорирующее коммерциализацию и деньги, делая их объектом одержимости.